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Publication de l’outil CRISPOR

L’infrastructure TEFOR a le plaisir de vous annoncer la publication dans la revue Genome Biology de l’outil CRISPOR dont l’objectif est de faciliter l’édition du génome d’animaux et de végétaux à l’aide du système CRISPR-Cas9. Cet outil a été créé en collaboration avec plusieurs laboratoires dont le Santa Cruz Genomics Institute de l’Université de Californie et est librement disponible directement sur le web via une interface conviviale et facile d’utilisation.
Cet outil permet une meilleure sélection des sites de coupures des nucléases CRISPR-Cas9 et contribue à réduire le nombre d’animaux utilisés pour créer une lignée. Il est d’ores et déjà disponible pour plus de 100 espèces.
Ainsi, l’infrastructure TEFOR et son réseau EFOR participent à l’amélioration des méthodes d’édition du génome chez les espèces modèles.

 

L’article est accessible ici :
Genome Biol. 2016 Jul 5 ;17(1):148
Evaluation of off-target and on-target scoring algorithms and integration into the guide RNA selection tool CRISPOR.
Haeussler M, Schönig K, Eckert H, Eschstruth A, Mianné J, Renaud JB, Schneider-Maunoury S, Shkumatava A, Teboul L, Kent J, Joly JS, Concordet JP.
PMID : 27380939 doi : 10.1186/s13059-016-1012-2.

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- Modèles animaux : 4 questions à Jean-Stéphane Joly, responsable du réseau EFOR

Dans le même thème, à lire aussi :

  • 1) La plateforme TACGENE (CNRS/MNHN/INSERM) et leurs collègues ont amélioré l’efficacité de l’édition du génome avec les nucléases TALE et CRISPR/Cas9 en utilisant des oligonucléotides modifiés :

- Improved Genome Editing Efficiency and Flexibility Using Modified Oligonucleotides with TALEN and CRISPR-Cas9 Nucleases.
Renaud JB, Boix C, Charpentier M, De Cian A, Cochennec J, Duvernois-Berthet E, Perrouault L, Tesson L, Edouard J, Thinard R, Cherifi Y, Menoret S, Fontanière S, de Crozé N, Fraichard A, Sohm F, Anegon I, Concordet JP, Giovannangeli C.

Cell Rep. 2016 Mar 8 ;14(9):2263-72
PMID : 26923600 doi : 10.1016/j.celrep.2016.02.018.

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  • 3) Tribune dans Le Monde et interview dans le Figaro de Jean-Stéphane Joly : l’édition du génome et la société
    - lemonde.fr
    - lefigaro.fr

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